مرکز آموزش­های عالی آزاد و آموزش­ های خاص براساس ابلاغیه ۳۹۵۸۶ / ۲ مورخ ۱۳۹۰/۰۳/۰۱ وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، فعالیت خود را در دانشگاه جامع علمی- کاربردی بطور رسمی آغاز نمود. این مرکز از طریق تمرکز آموزش ­های کوتاه مدت (تک درس، تک پودمان، خاص و ...) غیرحضوری اعمال مدیریت بر آموزش­ های عالی آزاد در سراسر کشور از خرداد ۱۳۹۰ تشکیل شده است. مرکز آموزش­ های عالی آزاد و آموزش ­های خاص در چارچوب مقررات مربوط  و ماموریت­ های دانشگاه جامع علمی­ کاربردی نسبت به سازماندهی موسسه­ های مجری دوره­ های مذکور اقدام می‌نماید. توسعه آموزش‎های کوتاه مدت مهارتی و پودمان های خاص مورد نیاز توسعه فرهنگی، اجتماعی و اقتصادی ضمن بهره گیری بهینه از امکانات بالقوه آموزشی بخش‌های مختلف غیر دولتی و دولتی، هدف اساسی این مرکز می باشد. 

 پذیرش دانشجو در دوره های کاردانی پودمانی غیرحضوری مدیریت خانواده و دهیاری و امورشوراها و کارشناسی حرفه ای مدیریت خانواده هم اکنون توسط واحد آموزش‌های خاص مرکز آموزش های عالی آزاد و آموزش های خاص دانشگاه در دست اجراست. این تجربه می تواند برای سایر رشته ها هم بررسی و اجرایی شود.